位于磨心山月平岗巅南，建于请乾隆年间（1736——1795），距今有240多年历史。1983年，高亭居士陶福根牵头募资重修，由大雄宝殿，三圣殿、蓬莱园等组成。上海同济大学教授陈从周为慈云庵重写了门匾并撰写“潮有音松听韵，山不尽水无边”门联。1985年3月，经县人民政府批准为宗教旅游胜地、文物保护单位，对外开放。

    后大殿西侧，树有大理石碑刻一块，刻中国佛教协会会长赵朴初在1989年10月视察慈云庵时，即兴填写并手书的《江城子·访岱山蓬莱仙岛有作》词一首，词为“使知佛土遍三千，上仙山，礼金仙。身现重重，无尽现华严，禅指心开楼阁起，观大海，碧于蓝。经房一老独悠然，一再参，展慈颜。收录潮间，依然是无言，但记屏缘休歇好，闻用眼，耳须观”。

    庵门前也有大理石碑刻一块，刻有著名书法家、文史专家姜东舒在1990年5月参观慈云庵后，所作并书写的诗一首，诗曰：“涉遍名山多少险，千山难比此山研；危峰长啸沧波涌，宝殿幻身明镜悬。老纳无眠六十载，仙芝藏雾百千年；如何灵境知音少，一笑人间事亦然”。